更要命的是，除了个别的一些老头子外，即使是旗本武士，他们大部分也都没有见过战场，最多都只有在酒馆打架斗殴的经历。跟曾经追随明国将官以战代练，与女真建奴、闽南海贼多次厮杀过，见识了许多大场面的长州新军相比，简直是兔子与饿狼的差别——即使是单兵格斗，旗本武士同样也打不过对手！
还有，长州军已经装备了大量的金属胸甲、新式火枪、要塞炮和野战炮，能够排列成相当整齐的军阵。而幕府军则还在使用战国时代的遗留武器，大多数人都没有铠甲，火炮数量更是少得可怜，而且质量比朝鲜人的炮还差，就这样都还敢夸耀成“国崩”。到了战场上，相当一部分缺乏经验的幕府军将士，更是真的把打仗当成了特大规模的群殴：都到这年头了，居然还有人想要跟敌人进行“一骑打”（将领单挑）的！
这样全方位的落后，简直是让人绝望，但不管再怎么绝望，幕府都一定要抓紧这段稍纵即逝的宝贵时间，设法拉出一支能够跟长州藩正面较量不落下风的精锐新军——否则德川家的天下就要完蛋了！
鉴于长州藩明显得到了明国官府的大力支持（为了“挟大明以自重”，长州藩在日本国内进行了比较夸张的宣传，以威吓各路对手），德川家光将军转而请“南蛮人”帮忙，向荷兰人下了一份巨额的火炮和军事教官订单。荷兰人也果然没有辜负将军的厚望，很快就送来了大批威力强大的火炮和数十名经验丰富的军事教官。而幕府的铁炮工匠，也在重赏之下，结合缴获的若干实物，成功地自制出了一批燧发枪。
于是，在德川家光的全力支持之下，幕府成功组建起了一支总兵力为五千人的近代化新军，依靠荷兰教官的悉心指导，很快就把西班牙大方阵、棱堡、炮兵战术等一系列新鲜花样给学得有模有样。而荷兰教官在课堂上讲解的各种欧洲战场经典战例，也让孤陋寡闻的日本武士们颇有耳目一新之感。
总而言之，通过上述种种努力，幕府军终于逐渐开始了从封建时代军队向近代化军队的改变。
但是，这种安心治军讲武的日子没能持续多久，一系列突如其来的意外变故，就迫使德川家光将军不得不仓促动用了这支尚未完成训练的近代化军队“雏形”，将这支军队提前拉上了战场：
在今年的春夏时节，已经基本消化完上一次胜利果实的长州藩，终于开始了新一轮的大规模军事扩张行动——在明国援军的大力协助之下，毛利军发动了对九州岛的侵攻作战（从德川幕府的角度来看是这样，至于具体谁主谁次，就各有各的想法了），一举击败和降伏了号称“九州第一强兵”的萨摩藩岛津家！
这个噩耗让德川幕府上下大为震动——自从宽永三年的征长战争失败，直属军队遭到毁灭性打击之后，德川幕府对京都以西各藩国的威慑力大为缩水，基本上已经是号令难出大阪，只能坐视长州藩在西国逐步扩张，通过文武各种手段，吞并和降服关西诸藩，一步步恢复了毛利家在战国时代末期的极盛版图。
按照诸位幕府重臣的看法，在长州藩已经威震天下、制霸山阴、山阳两道的情况下，毛利家之所以一直还没有发兵进京“上洛”，实现其先祖毛利元就的宏愿，主要是因为在背后还有九州的萨摩藩、福冈藩、肥后藩、佐贺藩，四国的土佐藩等一系列强藩牵制。如果在毛利家出动倾国之兵与幕府鏖战近畿的时候，这些藩国被幕府说动过来捡便宜，往长洲藩的背后狠狠捅上一刀，那么毛利家的霸业就有瞬间崩塌的危险。
所以，在长州藩与幕府再一次展开较量之前，毛利家势必要首先厘清西国后院，保证后路无忧。尤其是从平安时代就统治南九州的萨摩藩岛津家，更是毛利家一统西国的头号敌手——德川家光原本以为，长州藩固然近来实力剧增，但萨摩藩也绝非弱者，长洲与萨摩之战必然旷日持久。没想到明国这回竟然违背了将日本列为不征之国的承诺，亲自出兵东征（讨伐日本的时候，黄石依然打着大明福宁军的旗号），派遣了他们最善战的传奇名将和最精锐的百战雄师，大举渡海协助长州藩攻略萨摩！如此沉重的筹码被押到了长州军一方之后，饶是岛津家的萨摩武士再怎么彪悍善战，也依然是一败涂地，只得向毛利家开城降伏
而九州岛上的其余各藩更是闻风丧胆，纷纷暗中向毛利家派遣投诚使节，眼看着就要背离德川幕府！
如此一来，不仅幕府在西国的长崎、平户等据点已经孤悬敌后，就连京都和大阪都要有危险了！
——更可怕的是，根据来自京都的小道消息，就连某些朝廷公卿似乎都有“暗通长州”的迹象……
这个消息简直让德川家光如坐针毡：他清楚地记得，当初开创室町幕府的足利尊氏大将军和“南朝军神”楠木正成，是如何利用天皇的圣旨和公卿的影响力，一举掀起轰轰烈烈的全国性倒幕狂潮，在极短时间内就打败镰仓幕府的往事。如今的长州藩本身就够难对付的了，更别提它背后还有明国这个庞然大物，如果朝廷这个墙头草也对江户幕府落井下石，授予毛利家倒幕的大义名分……那后果简直是不堪设想啊！
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